Por regla general, cuando una operación falla o se tienen sospechas de un error, se debe inspeccionar el log de errores del servidor MySQL, que normalmente tiene un nombre como nombre_host.err, o posiblemente mysql.err en Windows.

Durante la resolución de problemas, usualmente es mejor ejecutar el servidor MySQL desde la línea de comandos, en lugar de utilizar mysqld_safe o como servicio de Windows. Ejecutándolo como se indica, se podrán ver los mensajes que mysqld imprime en la pantalla, y hacerse una mejor idea de lo que está sucediendo. En Windows, el servidor debe iniciarse con la opción --console para que la salida se dirija a la ventana de DOS utilizada.

Pueden utilizarse los Monitores InnoDB para obtener información sobre un problema. Si el problema está relacionado con el rendimiento, o el servidor parece estar congelado, se debería utilizar innodb_monitor para ver información acerca del estado interno de InnoDB. Si el problema es con bloqueos, debe utilizarse innodb_lock_monitor. Si el problema es en la creación de tablas u otra operación del diccionario de datos, debe emplearse innodb_table_monitor para imprimir los contenidos del diccionario de datos interno de InnoDB.

Si se sospecha que una tabla está corrupta, hay que ejecutar CHECK TABLE sobre ella.