La replicación en MySQL funciona para tablas InnoDB del mismo modo que lo hace para tablas MyISAM. Es posible usar replicación en una forma en que el tipo de tabla en el servidor esclavo no es igual a la tabla original en el servidor maestro. Por ejemplo, se pueden replicar modificaciones de una tabla InnoDB en el servidor maestro sobre una tabla MyISAM en el servidor esclavo.

Para configurar un nuevo esclavo para un servidor maestro, se debe realizar una copia del espacio de tablas InnoDB y de los ficheros de registro, así como de los ficheros .frm de las tablas InnoDB, y mover las copias al servidor esclavo. El procedimiento adecuado para esto se encuenta en Sección 15.9, “Trasladar una base de datos InnoDB a otra máquina”.

Si se puede detener el servidor maestro o un esclavo existente, se puede tomar un backup en frío del espacio de tablas InnoDB y de los ficheros de registro y utilizarlos para configurar un servidor esclavo. Para crear un nuevo esclavo sin detener ningún servidor, se puede utilizar la herramienta comercial InnoDB Hot Backup tool.

Una limitación menor en la replicación InnoDB es que LOAD TABLE FROM MASTER no funciona con tablas de tipo InnoDB. Hay dos posibles soluciones:

Las transacciones que fallen en el maestro no afectan en absoluto la replicación. La replicación en MySQL se basa en el registro (log) binario donde MySQL registra las sentencias SQL que modifican datos. Un esclavo lee el registro binario del maestro y ejecuta las mismas sentencias SQL. Sin embargo, las sentencias emitidas dentro de una transacción no se graban en el registro binario hasta que se confirma la transacción, en ese momento todas las sentencias son grabadas de una vez. Si una sentencia falla, por ejemplo por infringir una clave foránea, o si se cancela una transacción, ninguna sentencia se guarda en el registro binario y la transacción no se ejecuta en absoluto en el servidor esclavo.