
  Linux frtzs HOGYAN


    Ram Samudrala |(me@ram.org)|

v1.1, 2003 jnius 17.
------------------------------------------------------------------------
/Hogyan ksztsnk nagy teljestmny Linux frtket./
------------------------------------------------------------------------


    1. Bevezets

Ez a dokumentum lerja hogyan ksztettem el a kutatsaimhoz
<http://compbio.washington.edu> szksges nagy teljestmny Linux frtket.

Az albbi informcikat a sajt felelssgedre hasznld. Nem vllalok
felelseget semmilyen cselekedetedrt, amelyet ezen HOGYAN elolvassra
alapozol. Eme HOGYAN legfrissebb vltozata megtallhat a
http://www.ram.org/computing/linux/linux_cluster.html honlapon.

Szemben ms dokumentumokkal, melyek ltalban beszlnek arrl hogyan
kell frtket kszteni, ez egy specifikus lers arrl, hogy a mi
laborunk miknt ksztette el azt. gy nem csak a szmtsi szempontok
rszleteit, hanem az asztali szmtgp, laptop, s a szerver ltalnos
szempontjait is tartalmazza. A dokumentum fleg bels hasznlatra
kszlt, de feltettem webre is, mivel szmos e-mail-t kaptam amik
ugyanezekrl az informcikrl rdekldnek. Mostanban - ahogy egy msik
64 csompontos frtt tervezetem - azt talltam, hogy nincs informci
arrl, pontosan hogyan gyjthetsz ssze olyan komponenseket amibl Linux
alatt megbzhatan mkd csompontokat hozhatsz ltre. Olyan informci
ami nem csak a csompontokkal trtn szmtst, hanem azok
szksgleteit is tartalmazza. Leginkbb arra hasznlhat ez a HOGYAN,
hogy bemutassa milyen tpus hardverek mkdnek jl Linux alatt s
milyenek nem.


    2. Hardver

Ez a fejezet a hardver vlasztsommal foglalkozik. Az ismert hardver
problmk <#known_hardware_issues> fejezetet leszmtva feltettem, hogy
minden /tnyleg/ jl mkdik.

A hardver teleptse egyszer, a legtbb rszlet benne van a
kziknyvben. Minden rszben a hardverlista a megrendels sorrendjben
tallhat (a legjabb a legels).


    2.1 Csompont hardverek

32 db gp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 XEON 2.4GHZ 533FSB CPU
    * Supermicro X5DPR-1G2 alaplap
    * 2 512MB PC2100 DDR REG ECC RAM
    * 1 40GB SEA 7200 HD
    * 1 120GB SEA 7200 HD
    * Supermicro Slim 24X CDROM
    * CSE-812 400 C/B 1U doboz

32 db gp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 AMD Palamino MP XP 2000+ 1.67 GHz CPU
    * Asus A7M266-D w/LAN Dual DDR alaplap
    * 2 Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
    * 1 41 GB Maxtor 7200rpm ATA100 HD
    * 1 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
    * Asus CD-A520 52x CDROM
    * 1.44mb floppy meghajt
    * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb
    * IN-WIN P4 300ATX Mid torony hz
    * Enermax P4-430ATX tpegysg

32 db gp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 AMD Palamino MP XP 1800+ 1.53 GHz CPU
    * Tyan S2460 Dual Socket-A/MP alaplap
    * Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
    * 1 20 GB Maxtor UDMA/100 7200rpm HD
    * 1 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
    * Asus CD-A520 52x CDROM
    * 1.44mb floppy meghajt
    * ATI Expert 98 8mb AGP monitorvezrl
    * IN-WIN P4 300ATX Mid torony hz
    * Intel PCI PRO-100 10/100Mbps hlzati krtya
    * Enermax P4-430ATX tpegysg

32 db gp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
    * Supermicro 370 DLE Dual PIII-FCPGA alaplap
    * 2 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
    * 1 20 GB Maxtor ATA/66 5400 RPM HD
    * 1 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
    * Asus CD-S500 50x CDROM
    * 1.4 MB floppy meghajt
    * ATI Expert 98 8 MB PCI monitorvezrl
    * IN-WIN P4 300ATX Mid torony hz


    2.2 Szerver hardver

1 db szerver kls hasznlatra (informci terjeszts) az albbi
sszelltssal rendelkezik:

    * 2 AMD Palamino MP XP 2000+ 1.67 GHz CPU
    * Asus A7M266-D w/LAN Dual DDR
    * 4 Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
    * Asus CD-A520 52x CDROM
    * 1 41 GB Maxtor 7200rpm ATA100 HD
    * 6 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
    * 1.44mb floppy meghajt
    * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb
    * IN-WIN P4 300ATX Mid torony hz
    * Enermax P4-430ATX tpegysg


    2.3 Asztali szmtgp hardver

1 db asztali szmtgp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 AMD XP 2600 MP CPU
    * MSI K7D Master-L DUAL MS-6501 alaplap
    * 4 1024MB PC2100 DDR REG ECC RAM
    * 1 40GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
    * 2 120GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
    * PIONEER DVR-AO5 IDE DVD-RW
    * 1.44mb floppy drive
    * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvezrl krtya
    * IN-WIN P4 300ATX Mid torony hz
    * Intel PCI PRO-100 10/100Mbps hlzati krtya
    * 450W ENERMAX P4-430ATX tpegysg
    * CREATIVE SB 128 5.1 PCI hangkrtya

2 db asztali szmtgp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 AMD XP 2600 MP CPU
    * MSI K7D Master-L DUAL MS-6501 alaplap
    * 2 512MB PC2100 DDR REG ECC RAM
    * 1 40GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
    * 2 120GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
    * MSI 52X24X52X CR52-A2 CD-RW
    * 1.44mb floppy drive
    * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvezrl krtya
    * IN-WIN P4 300ATX Mid torony hz
    * Intel PCI PRO-100 10/100Mbps hlzati krtya
    * 450W ENERMAX P4-430ATX tpegysg
    * CREATIVE SB 128 5.1 PCI hangkrtya

1 db asztali szmtgp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 AMD Palamino MP XP 2000+ 1.67 GHz CPU
    * Asus A7M266-D w/LAN Dual DDR
    * 2 Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
    * Ricoh 32x12x10 CDRW/DVD Combo EIDE
    * 1 41 GB Maxtor 7200rpm ATA100 HD
    * 1 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
    * 1.44mb floppy meghajt
    * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb
    * IN-WIN P4 300ATX Mid torony hz
    * Intel PCI PRO-100 10/100Mbps hlzati krtya
    * Enermax P4-430ATX tpegysg

1 db asztali szmtgp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 Intel Xeon 1.7 GHz 256K 400FS
    * Supermicro P4DCE Dual Xeon alaplap
    * 4 256mb RAMBUS 184-Pin 800 MHz RAM
    * 2 120 GB Maxtor ATA/100 5400 RPM HD
    * 1 60 GB Maxtor ATA/100 7200 RPM HD
    * 52X Asus CD-A520 INT IDE CDROM
    * 1.4 MB floppy meghajt
    * Leadtex 64 MB GF2 MX400 AGP
    * Creative SB LIVE Value PCI 5.1
    * Microsoft Natural billentyzet
    * Microsoft Intellimouse Explorer
    * Supermicro SC760 nagy torony hz, 400W-os tpegysggel

2 db asztali szmtgp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 AMD K7 1.2g/266 MP Socket A CPU
    * Tyan S2462NG Dual Socket A alaplap
    * 4 256mb PC2100 REG ECC DDR-266Mhz
    * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
    * 50X Asus CD-A520 INT IDE CDROM
    * 1.4 MB floppy meghajt
    * Chaintech Geforce2 MX200 32mg AGP
    * Creative SB LIVE Value PCI
    * Microsoft Natural billenytzet
    * Microsoft Intellimouse Explorer
    * nagy torony hz, 300W-os tpegysggel

2 db asztali szmtgp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
    * Supermicro 370 DLE Dual PIII-FCPGA alaplap
    * 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
    * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
    * Asus CD-S500 50x CDROM
    * 1.4 MB floppy meghajt
    * Jaton Nvidia TNT2 32mb PCI
    * Creative SB LIVE Value PCI
    * Microsoft Natural billentyzet
    * Microsoft Intellimouse Explorer
    * nagy torony hz, 300W-os tpegysggel

2 db asztali szmtgp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
    * Supermicro 370 DLE Dual PIII-FCPGA alaplap
    * 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
    * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
    * Mitsumi 8x/4x/32x CDRW
    * 1.4 MB floppy meghajt
    * Jaton Nvidia TNT2 32mb PCI
    * Creative SB LIVE Value PCI
    * Microsoft Natural billentyzet
    * Microsoft Intellimouse Explorer
    * nagy torony hz, 300W-os tpegysggel

2 db asztali szmtgp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
    * Supermicro 370 DE6 Dual PIII-FCPGA alaplap
    * 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
    * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
    * Ricoh 32x12x10 CDRW/DVD Combo EIDE
    * Asus CD-A520 52x CDROM
    * 1.4 MB floppy meghajt
    * Asus V7700 64mb GeForce2-GTS AGP monitorvezrl krtya
    * Creative SB Live Platinum 5.1 hangkrtya
    * Microsoft Natural billentyzet
    * Microsoft Intellimouse Explorer
    * nagy torony hz, 300W-os tpegysggel

3 db asztali szmtgp az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
    * Supermicro 370 DE6 Dual PIII-FCPGA alaplap
    * 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
    * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM merevlemez
    * Ricoh 32x12x10 CDRW/DVD Combo EIDE
    * 1.4 MB floppy meghajt
    * Asus V7700 64mb GeForce2-GTS AGP monitorvezrl krtya
    * Creative SB Live Platinum 5.1 hangkrtya
    * Microsoft Natural billentyzet
    * Microsoft Intellimouse Explorer
    * nagy torony hz, 300W-os tpegysggel


    2.4 Tzfal, tjr hardver

1 db tzfal az albbi sszelltssal rendelkezik:

    * AMD Palamino XP 1700+ 1.47GHz CPU
    * MSI KT3 Ultra2 KT333 MS-6380E alaplap
    * 512 MB PC2100 DDR-266MHz DIMM RAM
    * 40GB Seagate 7200rpm ATA/100 merevlemez
    * Asus 52X CD-A520 INT IDE cdrom
    * 1.44 MB floppy meghajt
    * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvezrl krtya
    * 3 Intel Pro/1000T Gigabit Server ethernet krtya
    * 4U Black Rackmount acl hz

1 tjr (gateway) az albbi sszelltssal rendelkezik. Az tjr
tkrzse a tzfalnak, arra az esetre, ha az sszeomlana/elromlana.

    * AMD Palamino XP 1800+ 1.57GHz CPU
    * MSI KT3 Ultra2 KT333 MS-6380E alaplap
    * 512 MB PC2100 DDR-266MHz DIMM RAM
    * 40GB Seagate 7200rpm ATA/100 merevlemez
    * Asus 52X CD-A520 INT IDE cdrom
    * 1.44 MB floppy meghajt
    * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvezrl krtya
    * 3 Intel Pro/1000T Gigabit Server ethernet krtya
    * 4U Black Rackmount acl hz


    2.5 Egyb, kiegszt hardverek

Biztonsgi ments:

    * 2 Sony 20/40 GB DSS4 SE LVD DAT drives

Monitorok:

    * 2 17" Viewsonic VE700 LCD monitor
    * 1 20.1" Viewsonic VP201M LCD monitor
    * 1 22" Viewsonic P220F 0.25-0.27m monitor
    * 4 21" Sony CPD-G500 .24mm monitor
    * 2 18" Viewsonic VP181 LCD monitor
    * 1 17" Viewsonic VE170 LCD monitor
    * 2 Sun monitors

Nyomtatk:

    * HP colour laserject 4600dn


    2.6 "Kssnk ssze mindent egymssal" hardverek

KVM monitor kapcsolkat hasznlunk egy olcs monitorral, hogy "lssuk"
az sszes gpet.

    * 15" .28dp XLN CTL Monitor
    * 3 Belkin Omniview 16-Port Pro Switches
    * Belkin Omniview 2-Port Switch
    * APC AR203 netshelter rack unit

Ez egy j megolds, de azt hiszem nem felttlenl szksges. Amire
szksgnk van, az egy kis hordozhat monitor amely a PC htra
csatlakoztathat (stylus-al mkdik, mint a Palm). Nem tervezem tbb
monitorkapcsol illetve KVM kbelt hasznlatt.

A hlzat fontos:

    * 2 Netgear FS750NA 48 port/1 git network switch
    * 1 Netgear FSM750S 48 port/2 git network switch
    * 1 Netgear FS517TS 16 port/1 git network switch
    * 1 Netgear FS750NA 48 port network switch
    * 1 Netgear FS524 24 port network switch
    * 1 Cisco Catalyst 3448 XL Enterprise Edition 48 port network switch
    * 1 Netgear ME102NA Wireless Access Point
    * 1 Netgear MA401NA Wireless PCMCIA


    2.7 Kltsgek

A mi szlltnk a Hard Drives Northwest ( http://www.hdnw.com). Minden
szmtsi csompontrt a frtnkben (a kt processzort is belertve)
krlbell 1500-2000 USD-t fizettnk adval egytt. Az ltalnos clunk
az volt, hogy a kltsg 1000 USD alatt legyen processzoronknt
(belertve az egyb alkatrszek rt is).


    3. Szoftver


    3.1 Opercis rendszer: termszetesen Linux!

Az albbi kerneleket s disztribcikat hasznljuk:

    * Kernel 2.2.16-22, KRUD 7.0 disztribci
    * Kernel 2.4.9-7, KRUD 7.2 disztribci
    * Kernel 2.4.18-10, KRUD 7.3 disztribci
    * Kernel 2.4.20-13.9, KRUD 9.0 disztribci

Ezek a disztribcik jl mkdnek mita a frisstseket CD-n kldik s
nem kell megbzni a kls hlzatban a frisstsek beszerzshez.
"Tisztbbnak" tnnek mint a szoksos Red Hat disztribcik s a
belltsa nagyon stabil.


    3.2 Hlzati szoftver

A Shorewall 1.3.14a programot ( http://www.shorewall.net) hasznljuk
tzfalnak.


    3.3 Prhuzamos feldolgoz szoftver

Mi a sajt szoftvernket hasznljuk alkalmazsok prhuzamostsra, de
vannak tapasztalataink PVM-el s MPI-al. Szerintem ezeknek az elre
csomagolt programoknak az tbbletterhelse tl nagy. Azt ajnlom rjl
alkalmazs specifikus kdot a feladatodhoz (magnvlemny).


    3.4 Kltsgek

A Linux s a legtbb szoftver ami Linux rendszeren fut ingyen msolhat.


    4. Telepts, bellts s zemeltets


    4.1 A merevlemez belltsa

Ez a fejezet a merevlemez-partcionlsi stratgit rja le.

    | |

frtztt gpek:

hda1 - swap   (2 * RAM)
hda2 - /      (maradk hely)
hdb1 - /maxa  (teljes lemez)

asztali szmtgp (windows nlkl):

hda1 - swap   (2 * RAM)
hda2 - /      (4 GB)
hda3 - /spare (maradk hely)
hdb1 - /maxa  (teljes lemez)
hdd1 - /maxb  (teljes lemez)

asztali szmtgp (windows-szal):

hda1 - /win   (teljes disk)
hdb1 - swap   (2 * RAM)
hdb2 - /      (4 GB)
hdb3 - /spare (maradk hely)
hdd1 - /maxa  (teljes lemez)

laptop-ok (egy lemez):

hda1 - /win   (a teljes lemezmret fele)
hda2 - swap   (2 * RAM)
hda3 - /      (maradk hely)


    4.2 Csomagok belltsa

A frt gpeire a csomagok minimlis halmazt teleptettk. A
felhasznlknak megengedtk, hogy gy konfigurljk az asztali
szmtgpeket, ahogy akarjk.


    4.3 Opercis rendszer teleptse s karbantartsa


      Csomagok klnozsa s karbantartsa


      FAI

Az FAI ( http://www.informatik.uni-koeln.de/fai/) egy automatizlt
rendszer, amely Debian GNU/Linux opercis rendszer teleptsre
hasznlhat PC frtkn. Veszel egy vagy tbb szz PC-t, bekapcsolod s
nhny perc mlva a Linux fel van teleptve s be van lltva, futtatsa
az egsz frtn semmilyen beavatkozst nem ignyel.


      SystemImager

A SystemImager ( http://systemimager.org) egy szoftver, ami
automatizlja a Linux s szoftverek teleptst s a termels beindtst.


      Egyni klnozsi stratgia

Van egy teljesen elosztott rendszernk. Ezt azt jelenti, hogy minden gp
az opercis rendszer egy pldnyt tartalmazza. Az opercis rendszert
minden gpre manulisan telepteni knyelmetlen. A telepts
optimalizlshoz elszr egy gpet teleptettem s lltottam be
pontosan gy, ahogy akartam. Aztn ksztettem egy tmrtett tar
llomnyt az egsz rendszerrl amit egy CD-ROM-on helyeztem el. Vgl
errl klnoztam minden gpet a frtben.

A tar llomny ksztsre az albbi utastst hasznltam:

    | |

tar -czvlps --same-owner --atime-preserve -f /maxa/slash.tgz /

Egy |go| nev szkriptet hasznlok, ami veszi a hosztnevet s az IP cmet
mint argumentumot, s kicsomagolja a |slash.tgz| llomnyt a CD-ROM-rl,
majd lecserli a hosztnevet s az IP cmet a megfelel helyeken. A |go|
szkript s bemeneti llomnyai elrhetek a
http://www.ram.org/computing/linux/linux/cluster/
<http://www.ram.org/computing/linux/cluster/> cmen. Ezt a szkriptet
mdostani kell a TE frtd felptsednek megfelelen.

A Tom's Root Boot csomagot is hasznlom ( http://www.toms.net/rb/) arra,
hogy indtsam a gpet s klnozzam a rendszert. A |go| szkriptet el
lehet helyezni a CD-ROM-on vagy egy floppy lemezen ami a Tom's Root Boot
csomagot is tartalmazza. (trlhetsz nhny programot ebbl a csomagbl,
ha kifutsz a floppy lemez kapacitsbl).

Mg knyelmesebb, ha ksztesz egy indt CD-ROM-ot ami a Tom's Root
Boot csomagot s a |go| szkriptet, valamint a klnozni kvnt rendszer
tar llomnyt tartalmazza. Mdosthatod a Tom's Root Boot csomag
inicializl szkriptjt, hogy a |go| szkriptet futtassa (mindig be kell
majd lltanod az IP cmet, ha nem hasznlsz DHCP szolgltatst).

Egy alternatv lehetsg, hogy ksztesz egy sajt indt lemezt (mint
egy ment lemez), amely tetszsed szerinti kernelt s programokat
tartalmaz. Szmos dokumentum ltezik, ami lerja ezek ksztsnek
mdjt. A Linux Bootdisk HOWTO (
http://www.linuxdoc.org/HOWTO/Bootdisk-HOWTO/) is tartalmaz
hivatkozsokat ms elre gyrtott boot/root lemezekre.

gy kifejleszthetsz egy rendszert ahol az sszes dolog amit tenned kell
csak annyi, hogy behelyezed a CD-ROM-ot bekapcsolod a gpet, veszel egy
cssze kvt (vagy stit) s visszajssz megnzni a ksz klnt. Ezt az
eljrst ismtelheted annyiszor, ahny gped van. Ez az eljrs nagyon
jl mkdik nekem s ha van valaki aki beteszi s kiveszi a CD-ROM-okat
akkor mg jobb.

Rob Fantini ( rob@fantinibakery.com <mailto:rob@fantinibakery.com>)
mdostotta a fenti szkriptet, Mandrake 8.2 rendszer klnozshoz. Ez
elrhet a
http://www.ram.org/computing/linux/cluster/fantini_contribution.tgz cmen.

Jelenleg egy olyan rendszeren dolgozok, amelyikben minden egy CD lemezre
van felrakva, errl indul a gp s knnyen klnozhat. A kzeljvben
kzzteszem a mdszert.


      DHCP vagy begetett IP cm?

Ha van egy mkd DHCP szolgltatsod, akkor nem szksges jra
belltanod az IP cmet s ezt a rszt trlheted a |go| szkriptbl.

A DHCP elnye, hogy nem kell vacakolnod az IP cmekkel mert a
megfelelen belltott DHCP szerver szolgltatja azokat. Egy htrnya,
hogy egy kzponti szerveren van megvalstva (s ahogy mondtam azon
vagyok hogy elosszam a dolgokat amennyire csak lehet). Az IP cmek
hardver ethernet cmekhez val ktse is kellemetlen lehet, amennyiben a
gpet vagy a hosztnv csert a szoksos mdon kvnod vgrehajtani.


    4.4 Ismert hardver problmk

A hardverek ltalban tnyleg igazn jl mkdtek. Specifikus krdseket
az albbiakban sorolunk fel:

Az AMD dual 1.2 GHz gpek igazn melegszenek mkds kzben. Kett mr
rezheten nveli a szoba hmrsklett. Mg jk lehetnek asztali
szmtgpekhez, de a hts s az energia fogyaszts megfontoland,
amikor nagy frtk rszeknt hasznljuk ket. A korbban bemutatott AMD
Palmino konfigurci igazn jl mkdik, de azt ajnlom vegyl kt
ventiltort minden esetben, ez megoldotta az sszes instabilits
problmnkat.


    4.5 Ismert szoftver problmk

Nhny tar program nem gy kszti el a tar llomnyt, ahogy azt
elvrnnk (klnsen a szimbolikus hivatkozsok visszafejtsben
mutatkozik ez meg). A megolds, hogy hasznlj olyan tar programot, ami
jl csinlja, pldul a Red Hat 7.0 disztribciban lvt.


    5. Feladat vgrehajts a frtn

Ez a fejezet gy fejldik ahogy a frtm hasznlata alakul. Eddig azon
voltam, hogy megrjam a sajt zenet kld eljrsaimat, amellyel
klnbz gpeken fut processzek kommuniklnak egymssal.

Sok alkalmazs - klnsen a szmtgpes genomika terletn - masszvan
s knnyen prhuzamosthat. Ez azt jelenti, hogy j eloszts rhet el
azltal, hogy azonos feladatokat szrunk szt a gpek kztt (pldul
amikor a teljes genomot analizljuk azt a technikt hasznljuk, ami egy
gnen, proteinen dolgozik s minden processzor egy gnen, proteinen
dolgozhat idben, fggetlenl a tbbi processzortl).

Eddig nem kellet hasznlunk profi queue rendszereket, de ez
nyilvnvalan ersen fgg a futtatni kvnt alkalmazstl.


    5.1 Durva teljestmnyteszt

Egyszeren a legfontosabb programot futtattuk (a mi /ab initio/ protenin
folding szimulcis programunkat) egy Pentium 3 1GHz processzoros gpen
referencinak. A kvetkez eredmnyek szlettek:

    | |

Athlon 1.2 GHz processzor krlbell 16% gyorsabb
Xeon   1.7 GHz processzor krlbell 27% gyorsabb
Athlon 1.5 GHz processzor krlbell 38% gyorsabb
Athlon 1.7 GHz processzor krlbell 46% gyorsabb
Xeon   2.4 GHz processzor krlbell 62% gyorsabb

Igen, az Athlon 1.5 GHz gyorsabb, mint a Xeon 1.7-es mivel a Xeon csak
hat utasts per rajelet (IPC), mg az Athlon kilenc rajelet futtat
(szmolj!).


    5.2 Folyamatos zemid (uptime)

A gpek, mind hardver, mind szoftver tekintetben hihetetlenl stabilnak
bizonyultak. Egyszer lettek debuggolva (rendszerint az j gpek kzl
nhny hardver problmval rkezik) folyamatosan nagyon nagy terhels
alatt. Egy plda lthat alul. jraindtsok ltalban akkor trtnnek,
amikor elektromos zavar keletkezik.

    | |

  2:29pm  up 495 days,  1:04,  2 users,  load average: 4.85, 7.15, 7.72


    6. Ksznetnyilvnts

A kvetkez szemlyek segtettek ennek a HOGYANnak az elksztsben:

    * Michael Levitt ( Michael Levitt <mailto:michael.levitt@stanford.edu>)


    7. Irodalomjegyzk

Az albbi dokumentumok hasznosak lehetnek - ezek referencik olyan
forrsokra, amelyek a nagy teljestmny frtk hasznlatval foglalkoznak:

    * RAMBIN web page <http://www.ram.org/computing/rambin/rambin.html>
    * RAMP web page <http://www.ram.org/computing/ramp/ramp.html>
    * Ram Samudrala's research page
      <http://www.ram.org/research/research.html> (ebben a HOGYANban
      lert frttel elrt nhny kutatsi eredmnyt r le)


    8. Magyar fordts

A magyar fordtst Szalai Ferenc <mailto:szferi@angel.elte.hu_NO_SPAM>
ksztette (2003.05.19). A lektorlst Daczi Lszl
<mailto:dacas@freemail.hu_NO_SPAM> vgezte el (2003.05.21). Brmilyen
fordtssal kapcsolatos szrevtelt a linuxhowto@sch.bme.hu
<mailto:linuxhowto@sch.bme.hu_NO_SPAM> cmre kldjetek. Eme dokumentum
legfrissebb vltozata megtallhat a Magyar Linux Dokumentcis Projekt
<http://tldp.fsf.hu/index.html> honlapjn. A fordts javtva
2003.05.26.-n.

